تؤثر المبيدات الفطرية الجهازية في موقع واحد من المسبب الفطري حيث يمكنها أن تؤثر على عملية حيوية معينةمثل: تثبيط التنفس بكسر أحدى سلاسل انتقال الالكترونات في الميتوكوندريا, و بالتالي تثبط انتاج الطاقة.
كما تؤثر بعض المبيدات هذه على عملية تشكيل النوكليوتيدات التي هي البنية الرئيسية في تصنيع DNA و بالتالي تثبط انقسام الخلية الفطرية. و بعض هذه المبيدات تثبط تصنيع اللبيدات و الجبريلينات داخل الخلية الفطرية.
يؤدي استخدام المبيدات هذه بشكل مستمر إلى ظهور السلالات المقاومة.
*آلية ظهور السلالات المقاومة للمبيدات الفطرية الجهازية:
1-تثبط بعض المبيدات الفطرية الجهازية مثل Carboxin التنفس بكسر إحدى سلاسل انتقال الالكترونات في الميتوكوندريا و تؤدي إلى تثبيط انتاج الطاقة, كما يمكن أن تحدث المقاومة في الفطر من خلال تجوز السلسلة المتضررة, أو أن يشكل المبيد رابطة مع بعض مكونات الخلية و يصبح غير فاعل و يستمر الفطر بالنمو.

2- بعض المبيدات تثبط أنزيمات معينة مسؤولة عن خطوة من خطوات عملية حيوية معينة مثل: تصنيع البروتين أو البروتوبلاسم و في هذه الحالة تظهر السلالة المقاومة من خلال امتلاك بعض الفطريات لكمية كبيرة من الأنزيماتبعضها يرتبط بالمبيد بينما يبقى الجزء الآخر حراً يستمر في اكمال العملية الحيوية في الخلية الفطرية.
3-تصنع بعض الفطريات مواد كيميائية ترتبط مع المبيد الفطري و تخرج مع الاطراح.

Ngdm jHedv hglfd]hj hgt'vdm hg[ih.dm hgpf hlvhq jhedv ulg t'vd